基因擴增PCR主要有冰箱、超凈臺、加樣器、混勻器、天平等。加樣器、天平除了要專用外，還應(yīng)有定期校準。試劑分裝應(yīng)在超凈臺中進行，擴增反應(yīng)混合液應(yīng)使用分子生物學級的，試劑制備好后應(yīng)有質(zhì)檢：一是否有污染、二是檢測試劑的擴增效果。

　　基因擴增PCR的擴增與克隆方法：

　?、僖锏男蛄袘?yīng)位于基因組DNA的高度保守區(qū)，且與非擴增區(qū)無同源序列。這樣可以減少引物與基因組的非特異性結(jié)合，提高反應(yīng)的特異性

　?、谝镩L度：15－40bp為宜。引物過短或過長均可使反應(yīng)的特異性下降。

　?、垡锏膲A基盡可能隨機發(fā)布，避免出現(xiàn)數(shù)個嘌呤或嘧啶的連續(xù)排列，G+C堿基的含量在40%－75%之間。

　　④引物內(nèi)部應(yīng)避免形成二級結(jié)構(gòu)，特別是引物的末端應(yīng)避免有回文結(jié)構(gòu)。

　?、荻€引物不應(yīng)有互補序列，特別是3’端應(yīng)避免互補，以免形成“引物二聚體”，浪費引物。

　　⑥引物5’末端堿基無嚴格限制，在與模板DNA結(jié)合的引物長度足夠的條件下，其5’端堿基可不與模板DNA互補而呈游離狀態(tài)，因此可在引物5’端加上限制性內(nèi)切酶位點、啟動子序列或其它序列等以便于PCR產(chǎn)物的分析克隆等，引物的5’端至多可加10個堿基而對PCR反應(yīng)無影響。

　　基因擴增PCR的使用建議：

　　1、使用本制品時務(wù)必將Buffer反復(fù)混勻后再加，避免因組分不一導(dǎo)致結(jié)果差異；

　　2、配置和分裝反應(yīng)液時請一定使用新的（無污染的）噴頭以避免污染；

　　3、如擴增條帶多，可適當添加酶和dNTPs；

　　4、當多重PCR擴增產(chǎn)物的長度均在1kb以內(nèi)時，使用3%～4％濃度的Agarosegel進行電泳分離效果。